铃木园子的叔叔次郎吉不甘心失败，决定再次向怪盗基德发出挑战。他斥巨资制造了巨型飞船贝尔·雪利二世号，并以镶嵌有名贵宝石“天空的贵妇人”的戒指作为赌注，邀请基德在东京到大阪的六小时内完成这项任务。柯南、小兰等人受邀登船，电视台也前来报道。随着时间推移，基德与次郎吉的对决悄然展开。然而，飞船上突然出现了恐怖组织红色暹罗猫的身影。此前，他们袭击了国立东京微生物研究所，盗走了一种致命病毒，并计划在飞船上实施恐怖行动。柯南与基德不得不联手，共同对抗恐怖分子，保护船上无辜乘客的安全，一场惊心动魄的空中对决就此展开。