《攻壳机动队ARISEALTERNATIVEARCHITECTURE》聚焦草薙素子加入公安九课前的关键事件。故事发生在第四次世界大战后，新港市接连发生军用机器人暴走事件，背后牵扯出「火种」病毒与501机关的秘密实验。全身义体化的素子以军方调查员身份介入，在与未来九课成员巴特、陀古萨初次合作中，逐渐揭开幕后黑手——企图通过电子脑病毒控制义体士兵的阴谋。随着调查深入，素子直面自身记忆被篡改的真相，最终选择脱离军方体系。本作以赛博朋克风格呈现了素子从独行佣兵蜕变为团队核心的关键转折，同时揭示了笑脸男事件前的政治暗涌与科技伦理危机。