桐生战兔创造了新世界后，除了战兔和万丈龙我外，所有人都失去了与假面骑士及天空之壁相关的记忆，和平地生活着。战兔与龙我一边记录之前世界的事件，一边贩卖战兔的发明品维持生计。某天，龙我遇到了一位名为马渕由衣的神秘少女，她声称在之前的世界中被CrossZ抛弃并成为人体实验的受害者，责备龙我。与此同时，自称“Killbas”的神秘外星生命体从白色潘多拉嵌板中出现，袭击战兔。Killbas是Evolto的兄长，曾是Blood族的王者，拟态成传奇舞者柿崎悟志的外貌。他对龙我和由衣发动攻击，面对Killbas压倒性的力量，两人陷入危机。然而，关键时刻，Evolto出现并保护了龙我。Killbas企图利用潘多拉盒子的力量毁灭宇宙，昔日的同伴们因盒子力量恢复了记忆，聚集在龙我身边。龙我与Evolto组成了奇妙的搭档，共同对抗Killbas的威胁。究竟龙我能否拯救宇宙和由衣？Evolto的真正目的又是什么？