《史上最强弟子兼一》讲述了高中生白滨兼一从一个软弱受欺负的男孩成长为武术高手的故事。兼一在中学时经常被欺负，高中一年级时决定改变自己，加入了空手道部。然而，他却遭到空手道部成员大门寺的排挤，被迫与其比试。在绝望之际，转学生风林寺美羽出现，并带他来到名为“梁山泊”的道场修行武术。在经历了严苛的训练后，兼一的武术能力大幅提升，但也因此被不良组织“诸神黄昏”盯上，被迫与他们的刺客决斗。在成功瓦解“诸神黄昏”后，兼一又面临与“黑暗”组织弟子群“YOMI”的对决，争夺“史上最强”的称号。故事充满了励志与热血，展现了兼一不断突破自我、勇敢面对挑战的成长历程。