《皇家师姐6：地下兵工厂》讲述了女警杨菁菁与卧底台警程傲群和中警华志勇联手缉捕中国地下兵工厂的香港党羽的故事。党羽首领阿Paul的妹妹Edna并不赞同兄长的行动，而Paul的手下阿Ben对Edna有意，但Edna却爱上了华志勇。由于程傲群与华志勇的背景不同，两人经常发生冲突，程傲群个性风流，却暗中恋上了杨菁菁。Paul向中国兵工厂首领购买了大批枪械，并策划在湾仔抢劫以分散警方注意力。华志勇与阿Ben争夺Edna的芳心，但Edna与Paul的关系暴露后，Paul软禁了她。Edna试图报警并劝Paul投降，但Paul执迷不悟，最终被程傲群击毙。程傲群也因此赢得了杨菁菁的芳心。