《潜艇总动员：海底两万里》讲述了实习小潜水艇阿力和贝贝在深海中的冒险故事。在人类教练道哥的指导下，他们执行巡逻任务，期待着从实习生晋级为科研潜水艇。实习过程中，他们遇到了各种险情，如教练道哥被困在岩缝中，偶像德叔发动机故障掉进岩石里，飞机苏喜被浓雾围困等待救援。同时，他们也经历了许多有趣的狼狈场面，如搬运海参被喷黏液，运送电鳗被电击，停靠站轰然倒塌。阿力和贝贝的好朋友水下脚踏车石头和寄居蟹布丁也时常帮倒忙。这些困难和危机考验着他们的智慧和胆量，在战胜困难的过程中，他们增长了知识，积累了经验，增进了友谊，学会了合作，明白了爱与勇气能够战胜内心的恐惧，只要肯努力，梦想终会成真。