《神医大道公》讲述了同门师兄弟保生大帝与瘟君千年斗法的故事。瘟君因屡次败于保生大帝，唆使众神向玉帝告状，列举保生大帝的种种“罪状”。玉帝大怒，将保生大帝打入凡界，并命令他将一个品行顽劣的医官培养成名医，否则终生不得返回天庭。来到凡间的保生大帝化身为民间郎中吴夲，凭借高超医术和智慧赢得了渔家女三红的青睐。与此同时，被瘟君陷害贬下凡的黑龙和白虎也与吴夲结成同盟。瘟君在与吴夲的较量中惨败，被玉帝贬为凡人，但他不甘心就此罢手，继续暗中策划阴谋。吴夲与伙伴们齐心协力，既要完成玉帝的任务，又要应对瘟君的种种诡计，展开了一场充满智慧与勇气的较量。