《生化危机：恶化》的故事发生在美国中西部城市哈弗威尔的机场。克莱尔·雷德菲尔德如今是非政府组织的成员，致力于救助受生化武器侵害的受害者。当她抵达机场时，目睹了一名丧尸在人群中出现，恐慌迅速蔓延。机场警员被咬伤后，病毒迅速传播，乘客和员工接连感染。一架飞机坠毁在机场，乘客和乘务员也变成了丧尸。这是T病毒的再次爆发，七年前由保护伞公司开发的恐怖病毒如今落入恐怖分子手中，试图要挟美国政府。为应对危机，白宫派遣特工里昂作为特别指挥官，协助政府军队控制局势。里昂与当地特种部队合作，并与克莱尔重逢，两人一边击退丧尸，一边营救幸存者。随着事件的深入，他们逐渐察觉到背后隐藏着不可告人的内幕。