1990年，一艘外星飞船悬停在地球上空，人类发现里面挤满了虚弱的外星难民。这些被称为"大虾"的外星人被安置在南非约翰内斯堡的隔离区"第九区"。20年后，外星人口激增至180万，与人类冲突不断。MNU特工威库斯负责强制搬迁工作，却在任务中被外星神秘流体感染，身体开始异变。逐渐变成"大虾"的威库斯亲身体会到外星移民遭受的歧视与压迫。为保护外星父子克里斯托弗和其幼子，威库斯与MNU武装部队展开对抗。最终克里斯托弗成功启动飞船离开地球，承诺三年后回来治愈威库斯。影片以威库斯完全变异后孤独地在第九区等待为结局，留下深刻的人性反思。