《碟中谍2》讲述了特工伊森·亨特执行的一项危险任务。医学博士研制出一种名为“金美拉”的致命病毒，却在运输途中被前中情局特工肖恩劫持。伊森受命追回病毒，为此他必须寻求女神偷奈雅的帮助，因为奈雅是肖恩的前女友。在执行任务过程中，伊森与奈雅渐生情愫。奈雅假意被捕接近肖恩，却被识破身份。在激烈的交锋中，奈雅为保护病毒不惜将病原体注入自己体内。最终伊森与肖恩展开殊死搏斗，成功夺回病毒和解药，拯救了奈雅的生命，阻止了一场全球性生化危机。影片融合了高难度动作场面与复杂的情感纠葛，展现了特工为守护世界安危所付出的巨大牺牲。