在宇宙开拓时代，人类组建了ZAP SPACY组织进行资源开采。一支宇宙运输船小队突然改变航线，前往失去联系的边境行星波利斯。抵达后，船员们发现整个星球已成废墟。正当他们调查时，早已灭绝的怪兽突然出现。与此同时，神秘青年雷现身，展现出操控怪兽的能力。随着怪兽暴动愈演愈烈，雷的真实身份与波利斯毁灭的真相逐渐浮出水面。原来这一切与贝利亚奥特曼的复仇计划有关——这位堕落战士从宇宙监狱逃脱后，不仅袭击了光之国，更在暗中操纵着波利斯的怪兽军团。奥特战士们为守护宇宙和平，与贝利亚及其怪兽军团展开了惊天动地的终极对决。