《舞HiME》讲述了鸨羽舞衣与弟弟巧海乘坐邮轮前往风华学园途中，意外救起漂流在海上的神秘少女美袋命。这位手持大剑的少女刚被救上船，就遭到另一位神秘女子玖我夏树的追杀。舞衣将命带回学校后，发现自己被卷入了一场名为"HiME"的宿命之战——12位拥有特殊力量的少女必须互相战斗，她们各自的"最重要之人"将成为赌注。随着战斗升级，舞衣不仅要保护弟弟巧海，还要面对其他HiME少女的挑战，同时揭开风华学园背后隐藏的远古秘密。在友情与责任的抉择中，少女们各自为珍视之人而战，展开了一段交织着魔法、热血与成长的校园奇幻故事。