在东京闹市区的后巷里，普通高中生藤岛鸣海偶然目睹了一起可疑事件。不久后，他被同学彩夏带到了打工的"花丸拉面店"，意外遇见了三个自称"尼特族侦探"的怪人——柏青哥高手阿哲、军事宅少校和花花公子宏哥。当鸣海困惑之际，他误入了神秘的"NEET侦探事务所"，遇见了足不出户的天才黑客少女爱丽丝。这个看似家里蹲的女孩，实际是专门解决网络疑难案件的尼特族侦探首领。随着鸣海被卷入事务所的日常，他逐渐成为爱丽丝的助手，两人开始共同调查各种离奇事件，从网络诈骗到连环杀人案，在虚拟与现实交织的世界里揭开一个个隐藏在都市阴影下的真相。