《天才J之第二个J》講述了天才阿J與惡魔Satan之間的激烈對決。Satan利用偶然公式企圖通過超級人工智能Angel掌控全球人口數據，實現大規模殺戮。阿J為阻止Satan陷入昏迷，Satan的行動愈發猖獗。與此同時，初夏在地下拳擊館發現一名與阿J長得一模一樣的男子郭佑，他竟是Satan派來的臥底。警方與勺子叔合作，利用天眼系統“排污”救人，並關閉螞蟻金服公司的數據庫，選用助理劉小凡作為封鎖數據庫的關鍵人物。雖然Satan的計劃看似被遏制，但他是否會繼續殺人？昏迷中的阿J與郭佑究竟有何關係？郭佑潛入螞蟻金服公司的真正目的是什麼？一場關乎人類命運的鬥爭仍在繼續。