羊历3513年，青青草原的羊村突然收到来自微观世界的求救信号。喜羊羊带领小伙伴们借助灰太狼的发明变身成迷你小羊，驾驶着村长慢羊羊特制的神奇小车进入奇妙微观世界。在这个充满未知的新天地里，羊羊们遇到会跳舞的蒲公英、爱唱歌的露珠精灵，还要帮助被花粉困住的蜜蜂家族。每当危机来临，聪明的喜羊羊总能想出妙招，懒羊羊意外发现美食解法，沸羊羊用力量开路，美羊羊用温柔化解矛盾，暖羊羊细心照顾每个小伙伴。而追到微观世界的灰太狼，却因为体型过大闹出各种笑话。在这场充满童趣的冒险中，羊羊们学会了用新视角观察世界，体会到每个生命都值得被善待。