《神探朱古力》讲述了警探朱古力（许冠文饰）虽然自认为能力出众，但在警队多年始终只能担任帮办职位，与胆小怕事的助手蛋挞（许冠英饰）在警局无所事事。一天，朱古力的上司安排女儿娇娇（梅艳芳饰）作为新兵加入他的团队，但两人性格不合，互相看不顺眼。上司为了照顾女儿，特意分派一些简单的案件给朱古力，令他对娇娇更加不满。不久，朱古力接手了一起看似普通的寻人案件，但随着调查深入，案情变得扑朔迷离，谜团重重。朱古力不得不与娇娇和蛋挞联手，试图揭开真相，突破重重困难。影片融合了喜剧与犯罪元素，展现了三人之间从矛盾到合作的转变，最终共同破解悬案的过程。