《霹雳神州之苍玄泣第2部》讲述了东瀛将领犬若丸在中土的开疆计划取得成效后，中原与东瀛之间的冲突进一步升级。神鹤佐木被素还真唤醒，加入中原阵线对抗东瀛的侵略。东瀛派出最强的神风营，由中将京极鬼彦率领，发动全面进攻。在六祸苍龙、问天谴和神鹤佐木的共同努力下，素还真成功逼退东瀛大军，并拟定和平协议书，终结了中日之战，带来两国间的短暂和平。同时，百世经纶一页书为中原和平挑战军神源武藏，最终击败军神，促使东瀛停战。军神辞去职务，与莫召奴及渊姬退隐。然而，拳皇长曾我部神权与剑圣柳生剑影为寻找军神，继续追寻。天皇下令举办比武大会，选拔新任军神，以应对未来的挑战。