《境界的彼方》讲述了半妖少年神原秋人与异界士少女栗山未来的命运邂逅。在樱花纷飞的校园屋顶，秋人遇见了试图跳楼的未来——这位拥有操纵血液能力的少女，正因特殊体质而遭受同类追杀。两人逐渐发现彼此都与"境界的彼方"这一吞噬现实的虚无裂缝存在关联。随着未来血液中隐藏的秘密被揭开，他们不仅要对抗来自异界的妖梦，还要面对企图利用未来能力打开境界之门的黑暗势力。在战斗中，秋人觉醒了继承自妖怪父亲的强大力量，而未来则必须直面自己作为"血之一族"末裔的宿命。当境界的彼方开始侵蚀现实世界，这对少年少女在友情与羁绊的支撑下，展开了守护两个世界平衡的终极战斗。