在《美少女战士Crystal第三季》中，小兔与伙伴们面临前所未有的危机。死亡巴斯达的黑暗势力卷土重来，企图利用传说中的圣杯实现银河系统治。当小小兔被神秘力量绑架，水手战士们发现敌人竟能操控时空。随着外太阳系三战士接连失踪，冥王雪奈揭露了千年封印的真相——圣杯既是希望之源也是毁灭之钥。在土萌萤觉醒为水手土星的同时，小兔必须直面"救世主"与"毁灭者"的双重宿命。最终决战在时空裂缝展开，战士们以羁绊之力唤醒真正的圣杯光辉，而小兔与小小兔跨越时空的母女之情成为扭转战局的关键。本季首次完整展现银河影之帝国篇，揭开太阳系与外太阳系战士的命运纠葛。