《命运之夜——天之杯：恶兆之花》是改编自游戏《Fate/stay night》"Heaven's Feel"路线的剧场版动画。故事以间桐樱为主线，讲述卫宫士郎被卷入圣杯战争后的全新发展。十年前被魔术师卫宫切嗣收养的士郎，为成为"正义的伙伴"而每日修炼魔术。当第五次圣杯战争爆发，士郎与从者Saber缔结契约参战。与此同时，一直暗恋士郎的间桐樱身上开始出现异常，她体内潜藏的黑暗力量逐渐觉醒。随着战争进行，士郎发现这次圣杯战争与以往不同，背后隐藏着更深的阴谋。当樱的哥哥间桐慎二以御主身份参战后，事态进一步恶化。士郎必须在保护樱与履行正义之间做出抉择，而这场战争也将揭露十年前那场灾难的真相。