《假面骑士零一 千骑计划》讲述了飞电智能公司引领人工智能潮流，研发出AI机器人并投入实际运用后，被企图灭绝人类的“灭亡迅雷站”黑入系统，导致机器人暴走。为应对这一危机，政府成立了专门处理AI犯罪的特务机关。飞电或人原本立志成为搞笑艺人，却突然被告知要继承飞电智能公司社长之位，从而卷入这场事件。与此同时，灭亡迅雷站的成员亡正式登场，揭开了千骑系统的诞生过程和不破谏大脑中芯片的来源等谜团。天津垓为了打造千骑系统，指使亡向灭亡迅雷站送密钥，然而亡在与灭的接触中逐渐动摇。尽管千骑系统最终诞生，亡却并未得到应有的结局。故事围绕AI与人类的冲突展开，探讨了信任与背叛的主题。