《非自然死亡》讲述了在“非自然死亡原因研究所”（简称“UDI”）工作的三澄美琴的故事。作为一名专门探查死者死因的解剖医生，美琴始终坚持对“非自然死亡”进行深入调查。她认为，“非自然”的背后往往隐藏着需要法医追究的真相，比如伪装杀人、医疗失误、未知的疑难疾病等。然而，在日本，许多非自然死亡的死者未经解剖就被火化，导致真相被埋没。美琴与她的同事们——个性鲜明的法医、技术人员和调查员们，共同挑战这一现状，通过细致的解剖和调查，揭露死者背后的真实死因，为死者发声，为生者带来真相与正义。他们面对的不仅是复杂的案件，还有社会的偏见与制度的局限，但他们始终坚持追求真相的信念。