《月亮的秘密》讲述了三位女性在互联网论坛上倾诉心事，展开三段平行交织的情感故事。新加坡篇中，记者乐乐（范文芳饰）在成熟上司子星和憨厚月饼师阿心之间难以抉择，最终选择忠于内心，命运却另有安排。香港篇中，樱儿（李绮虹饰）即将与警察阿武结婚，却与他的孪生弟弟阿文渐生情愫，婚礼上她认出的竟是阿文，命运却将她拉回原点。澳门篇中，西西（李嘉欣饰）与男友振南同时失业，她在澳门与老同学王小东成为室友，意外怀孕却不知孩子父亲是谁，最终独自抚养孩子，命运却给出了最残酷的答案。三段故事在月亮的见证下展开，关于爱与选择、遗憾与释然，在世纪末的港岛奏响一曲温柔的命运交响。